Présentation antigénique et restriction par le CMH

Les lymphocytes T reconnaissent généralement un peptide associé à une molécule du complexe majeur d'histocompatibilité, ou CMH. Le récepteur T reconnaît donc une combinaison peptide-CMH, pas seulement un peptide libre. Les allèles du CMH diffèrent par les peptides qu'ils peuvent présenter, ce qui participe à leur diversité fonctionnelle.

La voie de classe I présente surtout des fragments issus de protéines cytosoliques aux lymphocytes T CD8 ; la classe II présente surtout des fragments provenant de compartiments endocytaires aux T CD4. Ce sont des grandes voies, avec des exceptions comme la présentation croisée. Une présentation compatible ne suffit pas à garantir une activation : état de la cellule présentatrice, co-signaux et contexte interviennent.

Dans un tableau fictif (M1 et M2 sont des noms d’allèles fictifs), un peptide P est indiqué comme présenté par l'allèle M1 mais non par M2 ; un clone T donné reconnaît P/M1 seulement. Une cellule portant M2 ne devient donc pas une cible de ce clone simplement parce qu'elle contient P. Si quatre cellules sur dix réunissent le peptide, M1 et les autres conditions explicitement imposées par un exercice, le décompte compatible est quatre ; cela ne prédit pas directement une réponse immunitaire réelle de 40 %.

Le tableau compare deux combinaisons peptide-CMH pour un même clone et rappelle que compatibilité de présentation et activation ne sont pas équivalentes. Les trois critères ne se remplacent pas. La compatibilité est ici une donnée pédagogique du modèle, et non un résultat calculé à partir d'une séquence inconnue.